강원도보건환경연구원은 2008년 11월 14일 전국보건환경연구원장회의”에서 『인플루엔자 유행감시 우수기관』으로 선정되어 보건복지가족부산하 질병관리본부로부터 우수 기관표창을 수상하였다. 강원도보건환경연구원은 1997년부터 강원지역에 유행하는 인플루엔자(독감)바이러스를 확인하여 인플루엔자주의보를 발령하고 있으며, 최근 조류인플루엔자(AI) 유행 가능성에 대비하여 년중 도내 병의원을 내원하는 인플루엔자 의심환자를 대상으로조류인플루엔자 감염여부를 신속히 확인하는 등 급성호흡 기질환과 관련된 전염병 예방에 힘쓰고 있다. 이를 계기로 강원도보건환경연구원은 보다 신속, 정확하게 인플루엔자의 유행을 감시하여 도내에 인플루엔자의 확산을 조기에 방지 할 수 있도록 최선의 노력을 다하기로 다짐하고 있다.