서울지방경찰청은 광우병 국민대책회의와 한국진보연대를 압수수색해 확보한 자료를 분석한 결과, 두 단체가 촛불집회 초기인 5월 6일부터 불법행위를 주도한 사실을 확인했다고 밝혔다.경찰은 한국진보연대가 지난 5월 중순 발행한 '투쟁지침'에 매일 촛불집회를 열고 가두선전을 강화하라는 등의 내용이 담긴 점을 근거로 들었다.또 서울 시청으로 행진을 시작할 것과 이른바 국민 토성을 쌓는데 필요한 모래 주머니의 숫자를 언급하는 등 자료엔 구체적인 행동 지침도 나왔다고 경찰은 설명했다.경찰은 국민대책회의 사무실에서 확보한 문건의 경우엔 촛불비옷 제작과 모래주머니를 이용한 국민토성 쌓기, 참가자 행진방향 안내 등 가두행진 계획이 담겨 있었다고 밝혔다.이에따라 경찰은 촛불 시위는 시민들이 자발적으로 조직한 것일 뿐 자신들은 개입한 바가 없다는 두 단체의 주장은 근거가 없다고 주장했다.